在明朝，南巖又進(jìn)行了大規(guī)模的擴(kuò)建，殿堂道房多達(dá)八百多間，可惜在1926年9月的一場(chǎng)大火，燒毀包括玄帝大殿在內(nèi)的殿房二百多間。南巖的古建筑，在手法上打破了傳統(tǒng)的完全對(duì)稱的布局和模式，使其與環(huán)境風(fēng)貌達(dá)到了高度的和諧統(tǒng)一。工匠們巧借地勢(shì)，依山傍巖，使建筑有的大起大落，有的小巧玲瓏；即有群體的四合院，也有單體的轉(zhuǎn)角樓，產(chǎn)生出強(qiáng)烈的藝術(shù)效果。

在南巖，一座伸出懸崖的石雕，歷來被人們津津樂道。這座石雕叫龍首石，也就是人們常說的“龍頭香”。龍頭香長(zhǎng)三米，寬零點(diǎn)五五米，是古代工匠采用圓雕、鏤雕、影雕等多種手法鑿刻的渾為一體的兩條龍。在萬仞峭壁上懸空伸展的兩條龍傳說是玄武大帝的御騎，玄武大帝經(jīng)常騎著它到處巡視。正因?yàn)辇堫^香的神秘和其地位，信士弟子們?yōu)楸眚\(chéng)，每次來朝武當(dāng)，都要燒“龍頭香”而走上那陰陽(yáng)生死的邊界。由于下臨萬丈深淵，燒龍頭香的人要跪著從窄窄的龍身上爬到龍頭點(diǎn)燃香火，然后再跪著退回來，稍有不慎，就會(huì)粉身碎骨。毫無疑問，龍頭香自打明朝建成以來，從上面摔下去的人不計(jì)其數(shù)，其情形目不慘睹。清康熙十二年，川湖部院總督下令禁燒龍頭香，并立碑戒告。碑文告誡人們說，神是仁慈的，心誠(chéng)則靈，不一定非要登到懸崖絕壁上燒香才算是對(duì)神的崇敬；所以不要復(fù)蹈前轍，毀掉寶貴的生命。禁燒龍頭香碑不僅保全了許多人的性命，同時(shí)也說明了一個(gè)道理，那就是珍愛生命。

南巖為道教所稱真武得道飛升之“圣境”，是武當(dāng)山36巖中風(fēng)光最美的一處。明永樂十一年（公元1413　年）重建，有宮殿、道房、亭臺(tái)等大小房間150間，賜額“大圣南巖宮”，到嘉靖三十一年（公元1552年）擴(kuò)大到460間。今存石殿，南天門，碑亭，兩儀殿等建筑。南巖，又名“紫霄巖”，因它朝向南方，故稱做南巖。它的全稱是大圣南巖宮，是武當(dāng)山人文景觀和自然景觀結(jié)合得最完美的一處。

據(jù)記載，在唐朝，八仙之一的呂洞賓就曾在南巖修道，至今這里還留有他作的一首詩(shī)。在元朝，武當(dāng)高道張守清在前人的基礎(chǔ)上“鑿巖平谷，廣建宮廷”，使南巖的建筑“隱林中之煊赫，聳層樓十二……” 而且當(dāng)時(shí)南巖的道人已多達(dá)一千人。因?yàn)閺埵厍逍藿蠋r，宏揚(yáng)武當(dāng)?shù)澜痰木薮蠊?jī)，當(dāng)時(shí)的皇帝賜封他為“體玄妙應(yīng)太和真人”。史書上盛贊當(dāng)時(shí)的南巖是“分列殿庭，晨鐘夕燈，山鳴谷震”。在這里，把“晨鐘暮鼓”用作了“晨鐘夕燈”，充分說明了當(dāng)時(shí)南巖建筑布局錯(cuò)落有致，到了晚上，這里的燈火成了別具特色的景觀。